Yûsei Fudô est un duelliste qui pratique le « Riding Duel », un combat de duel de monstre sur des motos appelées D-Wheel. Après être sorti vainqueur d'un duel, il rencontre un étrange adversaire. Ce duelliste ressemble à un monstre tiré d'une carte. C'est le début d'une grande aventure faite de duels et de rebondissements !